Projekt Družbena razslojenost in kulturne identitete v železni dobi na ozemlju Slovenije Trajanje projekta: 1. julij 2011–30. junij 2014 Vodja projekta: dr. Janez Dular Šifra: J6-4095
Projekt Prazgodovinska kolišča na Ljubljanskem barju, Slovenija: kronologija, kultura in paleookolje Trajanje projekta: 1. julij 2011–30. junij 2014 Vodja projekta: dr. Anton Velušček Šifra: L6-4157
Projekt Vzorci prilagajanja človekovih dejavnosti spremembam v okolju po zadnjem glacialnem maksimumu v Sloveniji Trajanje projekta: 1. julij 2011–30. junij 2014 Vodja projekta: dr. Dušan Plut (Filozofska fakulteta Univerze v Ljubljani) Šifra: J6-4016
Projekt TIP − Tradicija in inovativnost v prazgodovini Trajanje projekta: 1. februar 2011–31. januar 2014 Vodja projekta: dr. Ljubinka Teržan Šifra: N6-0004 (B)
Projekt Podatkovna zbirka grobe rimske keramike kot temelj za analizo poznoantične poselitve v Sloveniji Trajanje projekta: 1. maj 2009–30. april 2012 Vodja projekta: dr. Slavko Ciglenečki Šifra: J6-2202
Projekt Vloga Navporta v procesih romanizacije vzhodnoalpskega prostora Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Vodja projekta: dr. Marjeta Šašel Kos Šifra: J6-0107-0618-08
Projekt Multidisciplinarno raziskovanje kolišč na Ljubljanskem barju Trajanje projekta: 1. januar 2008–31. januar 2011 Vodja projekta: dr. Anton Velušček Šifra: L6-0137
Projekt ISOMEX. Rekonstrukcija (nekdanje) izotopske sestave padavin v Sredozemlju s pomočjo analize treh paleoklimatskih arhivov: drevesnih branik, stalagmitov in jezerskih sedimentov Trajanje projekta: 1. januar 2011–31. december 2013 Vodja projekta: dr. Dominique Genty
Projekt Razširitev enciklopedije naravne in kulturne dediščine na Slovenskem - DEDI II Trajanje projekta: 1. julij 2009–30. september 2010 Vodja projekta: dr. Daniel Vladušič Šifra: SM 4214
Projekt Mitska krajina kot vir znanj o urejanju prostora Trajanje projekta: 1. maj 2009–30. junij 2010 Vodja projekta: dddr. Andrej Pleterski Šifra: BI-HR/09-10-029