Fototeka obsega pretežno fotografsko gradivo z izkopavanj, topografskih akcij, študijskih potovanj in publikacij sodelavcev Inštituta za arheologijo. Najstarejši posnetki v našem fondu so iz leta 1928.
Zbirka dokumentov je nastala ob arheoloških topografskih akcijah pod okriljem Inštituta za arheologijo in v sodelovanju z nekaterimi drugimi ustanovami (Zavodi za varstvo naravne in kulturne dediščine, muzeji, Arheološkim oddelkom Filozofske fakultete in posamezniki izven arheološke stroke).
obsega geodetske posnetke in skice večinoma tistih arheoloških najdišč, kjer so raziskovali sodelavci Inštituta za arheologijo, pa tudi nekaj kopij iz drugih arhivov (npr. Pokrajinskega muzeja v Celju). Najstarejši dokument v našem fondu je kopija načrta iz leta 1916.
Podatkovna zbirka poznoantične naselbinske keramike z območja Slovenije poleg opisov posameznih kosov po vnaprej postavljenih enotnih kriterijih vsebuje še risbo, fotografijo površine in preloma ter po možnosti tudi arheometrične analize predmeta ali odlomka.
Zbirko sestavljajo monografije in zborniki v elektronski obliki, ki izhajajo v okviru Opera Instituti Archaeologici Sloveniae. V njih so objavljeni rezultati raziskav s področja arheologije, epigrafike in antične zgodovine. Večinoma je namenjena celovitim predstavitvam posameznih arheoloških najdišč oziroma arheoloških tem z območja jugovzhodnih Alp in zahodnega Balkana.
Digitalni arhiv je interna zbirka elektronske dokumentacije Inštituta za arheologijo. Vanjo shranjujemo arheološko, epigrafsko, arheozoološko, palinološko in arheobotanično gradivo.